Apesar de não ter garantido a vaga para a Copa do Brasil 2016 em campo, o Vitória fez valer o seu bom desempenho do Campeonato Brasileiro da Série B e disputará a segunda competição mais importante do Brasil.
A Federação Baiana de Futebol revelou em seu site que a CBF confirmou extraoficialmente que o Vitória terá vaga na Copa do Brasil 2016 por meio do ranking oficial nacional. O rubro-negro foi eliminado nas quartas-de-finais do Campeonato Baiano e por isso não ia obter vaga.
O Vitória está no pote B, que conta com Ponte Preta, Bahia, Sport, Vitória, Ceará, Criciúma, Avaí, Chapecoense, Náutico e ABC. O rubro-negro enfrentará uma das equipes do pote F composto por: Vitória da Conquista, Goianésia, Globo, Operário (MT), Náutico (RR), Aparecidense, Princesa do Solimões, Caldense e Gama.
As outras três vagas da Bahia será do Bahia, campeão baiano, Vitória da Conquista, vice-campeão baiano e Fluminense de Feira, campeão da Copa Governador do Estado.
