A FBF(Federação Baiana de Futebol) realizou um reunião do Conselho Técnico e definiu a fórmula de disputa do Campeonato Baiano de 2013. A competição ganhará um novo modelo de disputa com duas fases por causa do Copa do Nordeste 2013. O presidente Alexi Portela representou o Vitória.
A primeira fase, sem os participantes do Copa do Nordeste, será iniciada no dia 20 de janeiro e será finalizada no dia 17 de março. Os nove participantes (Bahia de Feira, Atlético, Fluminense, Vitória da Conquista, Serrano, Juazeiro, Juazeirense, Botafogo e Jacuipense) disputarão cinco vagas para a segunda fase e os dois serão rebaixados para a segunda divisão do Campeonato Baiano 2014. O campeão e o vice-campeão da primeira fase terão direitos a uma vaga na Copa do Nordeste 2014 e uma vaga na Copa do Brasil 2014, respectivamente.
Bahia, Feirense e Vitória disputarão a segunda fase que será iniciada no dia 20 de março e finalizada no dia 21 de abril. Os oito times serão divididos em dois grupos. No grupo A, ficarão Bahia, Feirense, 2º colocado e 4º colocado. No grupo B, ficarão Vitória, 1º colocado, 3º colocado e 5º colocado. A fórmula de disputa será simples, grupo contra grupo em jogos de ida e volta, o que garante no mínimo dois BaVis.
A fase final será disputada pelos campeões e vice-campeões de cada grupo em jogos de ida e volta. Os vencedores desses confrontos disputarão a grande final nos dias 12 e 19 de maio. O campeão terá direito a uma vaga na Copa do Nordeste 2014 e uma vaga na Copa do Brasil 2014, o vice-campeão terá direito a uma vaga na Copa do Nordeste 2014.
A Copa Governador do Estado 2013 dará uma vaga na Copa do Brasil 2014. O campeonato Sub-20 seguirá a mesma forma do Campeonato Baiano de profissionais.
